泮托拉唑钠肠溶片在临床上主要可以治疗十二指肠溃疡，反流性食管炎，如果和一些药物配合使用，还能够改善幽门螺旋杆菌，比如搭配阿莫西林、克拉霉素。但是要注意这种药物并没有办法治疗轻微的胃肠道疾病，比如，出现神经性消化不良时，使用这种药物并没有好的效果。在目前临床医学上，使用此种药物的不良反应较少，有个别的患者可能会有腹部疼痛、腹泻。