阿帕替尼的副作用一般有腹泻、呕吐、食欲减退以及大便出血等胃肠道不适症状，严重的还会引起消化道出血。还会对身体新陈代谢以及营养情况产生一定的影响，如引起低蛋白血症、低磷血症以及低钾血症等。也可能会对血液系统产生影响，如造成白细胞减少、血小板减少以及红细胞减少等现象。服用过多还可能引起肝功能出现异常。