区别主要是服用药物的水温不一样，开水冲服的水温要高，另外针对的药物也是不同的。开水冲服主要针对的是一些中成药物，通过开水冲服之后能够使药物的药效发挥更好。而温水冲服主要是用于一些西药，比如抗生素和酶类的药物，这些药物使用温水冲服比较好，是不可以使用开水冲服的，否则会导致药效降低。