跑步脚掌外侧疼有可能是刚刚跑步造成的软组织挫伤引起的疼痛，也有可能是脚底部长骨骨折造成的疼痛。如果疼痛比较严重者，一定要到医院通过X线片的查看具体的原因，才能够针对性的进行治疗，也可以在医生指导下口服一些止痛和活血化瘀的药物来综合治疗。在平时要适当的多注意休息，避免长时间走路或者是剧烈运动。