偶尔采取一次灌肠的方法进行退烧的治疗，对小孩没有什么特殊的不良影响和副作用。但是，如果经常采取这种方法进行退热的处理，有可能对孩子肠道的功能产生不良影响，导致孩子的肠道发生无菌性炎症反应。另一方面，甚至有可能影响到孩子肛门括约肌的控便功能，导致孩子出现大便失禁。