黄连上清丸的功效有泻火止痛、散风清热的作用。临床上对于急性化脓性中耳炎、急性结膜炎以及复发性口疮、急性化脓性中耳炎，牙宣等疾病有一定的治疗作用。而且对于肺胃火盛所导致的牙齿疼痛、咽喉肿痛、大便秘结，小便短赤有一定的作用。但是患者在用药期间一定要清淡饮食，避免食用辛辣和刺激性的食物。