酪酸梭菌活菌胶囊一般选择在饭后吃比较好。因为吃完饭后肠胃中有了一定的东西，然后再使用药物，能够发挥更好的药效。但也有一部分的患者会选择在饭前吃，如果是选择在饭前吃的话，吃过药物隔一段时间才能吃饭，一般是不会产生不良的影响。平时吃这种药物尽量将药放在冰箱中进行冷藏，才能保证药物的药效。