有很大的本质区别，胸内科主要是以药物治疗为主，外科主要是以手术治疗为主，胸内科包括心脏和肺两大器官疾病，比较常见的有冠心病、肺炎、慢性肺、肺结核等，这些疾病都可以通过药物治疗。胸外科主要是治疗一些通过药物无法解决的疾病，比较常见的是纵隔肿瘤、肺癌、心脏瓣膜病、食管癌、气胸等。