长时间的服用清胃黄连丸，有可能会导致患者出现肠胃不适的症状，比如有便秘、轻微恶心呕吐等症状。对于脾胃比较虚弱的患者，在大量长时间的服用以后，就有可能会导致患者的脾胃虚寒的症状加重。清胃黄连丸主要能够起到解毒消肿、消除胃火等功效，在服用药物一段时间后，症状彻底治愈以后就需要及时的停止用药。