小儿奇应丸的副作用还不是很明确。小儿奇应丸在治疗小儿肠道滋寄生虫病，小儿积食，小儿高热惊厥，以及小儿咳嗽、咳痰等症状中经常会用到。用药过程中可能产生的副作用，目前还没有确切的说法。不过，只要合理正确的用药，应该说是比较安全的。用药过程中注意观察孩子的反应。