三个月婴儿梅毒转阴也是有可能的。当婴儿出生后及时的给予青霉素类的抗生素进行治疗，有可能是将梅毒螺旋体进行彻底杀死治愈，因此这时候也要注意给宝宝适当的隔离，给予喂养，宝宝有利于身体的免疫力增强，也可以保证宝宝的生长发育。另外需要在医生的指导下及时的给予预防接种才有利于宝宝预防传染病的发生。