你好!小孩诉生殖器官疼痛的原因可有局部外伤、尿道炎、生殖器炎症等。如果局部没有跌伤或碰撞等外伤史的话，首先考虑是否有尿道炎症的可能，或者是有生殖器官炎症等疾病存在的可能，建议尽快带小孩去正规医院的儿科或泌尿生殖外科进一步检查，明确诊治，早日康复。