一般在短期内服用益生菌，是没有副作用的情况发生，益生菌是一种调整胃肠功能的药物，如果是宝宝长期大量服用，可能会导致出现有腹泻，食欲不振，恶心，呕吐等的情况发生。当宝宝有消化不良，拉肚子的情况，在医生的指导下适当服用益生菌进行治疗，另外也可以给予保暖，清淡饮食等综合性治疗才有利于身体的消化不良的情况，得到缓解和控制。