不典型川崎病不属于独立的疾病类型，通常指的是排除其他疾病后，未能满足川崎病的典型症状，如发热、眼结膜充血、口腔及咽部黏膜充血及干裂、手足硬肿、皮肤红斑、颈淋巴结肿大等。可以其中的两三条症状，或有影像学检查出有冠状动脉扩张等，其诊断主要依靠医生的个人经验以及对于药物的反应。