益生菌最好可以选择在饭后服用，因为饭后胃酸的含量比较少，此时会比空腹服用益生菌效果会更加好一些。如果空腹服用益生菌会导致细菌在强酸的环境下被杀死，这样可能会影响到益生菌的效果。适当的服用益生菌，对于改善菌群环境是有一定帮助的，但是不要长期应用，服用药物要谨遵医嘱。