一般是没有副作用的。益生菌属于调理肠道的药物，且对于缓解胃肠道紊乱导致的恶心以及呕吐症状，也可以得到改善，如果出现腹痛或者腹泻的症状，也可以适当的服用益生菌进行调理。但由于新生儿的肠胃并没有发育完全，因此在服用益生菌之前应严格遵循医生的指导，并且按照医生给的剂量服用。