打肝素最佳的时间一般是早上起床之后或者是吃午饭之前。肝素注射能够抗凝血治疗，同时还能够预防血栓栓塞形成，在早上进行注射，有利于人体对药物成分的吸收，可以使药效发挥达到峰值。如果患者早上注射会出现反胃或者是恶心的情况，也可以直接吃完早饭之后，午饭之前来进行注射。