肝素具有抗凝血的作用，它可以催化抗凝血酶，抑制多种凝血因子的活性，从而起到抗凝和抗栓的作用。并且肝素还可以抑制凝血酶和纤维蛋白的功能，有促进纤溶的作用，可以加速已经形成血栓的溶解消退。肝素的抗凝机制是比较复杂的，如果肝素使用过量，容易引起出血性的疾病。