自身免疫性肝病的诊断主要还是需要看，1生化指标，会有转氨酶和胆红素的持续升高，2免疫学指标，球蛋白以及IgG升高，大于20g/L，血中自身抗体阳性，且甲肝，乙肝，丙肝，丁肝和戊肝等病毒病原指标均为阴性，3影像学指标，提示有胆管明显狭窄，4组织病理学指标，提示有肝细胞坏死和碎屑样坏死。其中肝穿刺组织病理学指标是诊断自免肝的金标准。