肝囊肿做穿刺治疗有一定的风险。穿刺治疗本身就是有创治疗，尤其是囊肿长在与胆道交接的部位，可能会损害附近的大血管，甚至是胆管，一般在正规医院专业医生操作一下，可以将风险降到最低。对于单纯性胆囊肿通过穿刺治疗相对风险是比较低的，而且在治疗后患者的恢复也比较快，但是术后要做好防感染工作。