6岁宝宝肚脐眼正中痛，可能是由于以下几点原因导致的：1、可能是由于局部受到了细菌或病毒感染引起的。2、也有可能是局部着凉导致的。3、肚脐眼正中痛，也很有可能是平时经常用手去抓挠肚脐眼处，导致手中的细菌带入到了局部引起的。如果出现了这种情况，家长可以适当的在肚脐眼儿正中处进行轻轻的按摩，从而缓解疼痛程度。