宝宝吃益生菌的最佳时间通常需要在餐后服用，有利于调理肠道菌群。当幼儿出现腹胀腹泻的现象时，需要到医院进行全方面的检查，如果是有肠道菌群失调引起的，则需要在医师指导下服用益生菌进行调理。在用药期间需要养成少量多餐的饮食习惯，还需要注意腹部保暖，有利于自身肠道功能恢复正常。